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La détermination de l’espèce chez le chêne indigène est souvent problématique. Le chêne pédonculé, le chêne sessile et le chêne pubescent (Quercus robur, Q. petraea et Q. pubescens) sont de proches parents et leurs caractéristiques morphologiques, physiologiques et écologiques sont souvent semblables. Il n’existe aucun caractère (ni morphologique, ni génétique) qui permettrait à lui seul une détermination sûre de ces trois espèces. En règle générale, les chênes pédonculés et sessiles se distinguent aisément sur la base de la morphologie de la feuille, des différences de pilosité du dessous de la feuille et de la longueur du pétiole et du pédoncule. La pilosité longue des feuilles et des rameaux caractérise le chêne pubescent. En revanche, le chêne chevelu (Quercus cerris) se distingue clairement des trois autres espèces par plusieurs caractéristiques